Moin,
danke für das Bild. Dann kann ich ja anfangen.
Diese Verbräunungen sind völlig normal. Auch bei immergrünen Pflanzen sterben mit der Zeit alte Blätter ab. Normalerweise dauert das bei einer normal gewachsenen Thuja ca. 5 - 7 Jahre. Da die Pflanze aber formiert wurde/wird, verdichtet sich das ganze Astwerk natürlich extrem. Durch diese Verdichtung werden die inneren Zweige und Blätter nicht mehr genug mit Licht versorgt und sterben früher als normal ab. Da aber, ebenfalls durch diese Dichtheit, die toten Zweige nicht herausfallen können, sie bleiben ja hängen, fällt es unangenehm auf. Ebenfalls werden die einzelnen Etagen sehr luftundurchlässig, was gefährlich werden kann. Damit bei feuchter Witterung nicht irgendwann auf diesen toten Zweigen ein Schimmelpilz wächst, ist es wichtig, die einzelnen Kugeln mal etwas kräftiger "auszkämmen" oder schütteln oder wie auch immer man das nennen möchte. Man muss dafür sorgen, das die braunen, toten Teile rausfallen können.
Es kann auch mal nötig sein ca. 1/4 der schwächsten Zweige aus diesen Kugeln herauszunehmen um sie wieder etwas luftdurchlässiger zu machen. Da die Pflanze ja wächst und wieder regelmäßig nachgeschnitten wird, werden diese anfangs etwas lockeren Kugeln mit der Zeit auch wieder dicht.
Fazit: für die Gesunderhaltung der Pflanze bekommt sie im Frühjahr eine gute Gabe organischen Garten-Volldünger. Ab Mai bis September wird nicht mit Wasser gespart, aber auch sonst sollte sie nie austrocknen. Der Schnitt wird wie gehabt durchgeführt. Aber spätestens im dritten Jahr sollten die Kugeln im Mai/Juni mal leicht ausgeschnitten werden. Das Ausschütteln würde ich jährlich im Herbst machen, damit das tote Zeug im naßkalten Winter nicht anfängt zu faulen.
Als kleinen Tipp für den Kugel-Schnitt: nicht 100%ig rund schneiden. Die unteren Bereiche sollten immer etwas breiter bleiben, z.B. ähnlich wie ein auf die gerade Seite gelegtes großes "D". Die Kanten sollten natürlich abgerundet werden, aber eben nicht richtig kugelig. Die Oberseite wird etwas stärker, also leicht flach-kugelig geschnitten. Weil die oberen Bereiche eines Gehölz, hormonell bedingt, immer stärker wachsen als die unteren würden sie die unteren Zweige 1.) "unterdrücken" und 2.) zu sehr beschatten wodurch sie dann verkahlen und die Kugel zu einem Pilz wird.
Achso, die weißen Stellen noch. Es könnte sich, man sieht es aber etwas schwer, um irgendein saugendes Insekt handeln, eventuell eine Thuja-spezifische Wolllaus. Mit dem Ausschütteln solltes Du schon so einiges davon entfernen können. Danach dann noch eine Behandlung mit den biologischen Insektiziden Spruzit oder Neem. Auch solche Schädlinge können durch die Verdichtung der Äste gefördert werden. Hier ist es aber besser, mit Proben in eine gute (!) Gärtnerei/Baumschule zu gehen und diese dort von fachkundigen Augen mit einer Lupe begutachten zu lassen bevor Du Insekten-Gifte versprühst. Spart Geld.